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蛋白質(zhì)印跡——膜選擇
2022.11.29   點(diǎn)擊3411次

PVDF膜和NC膜作為Western印跡應(yīng)用中最常用的兩種類型的膜,各有什么特點(diǎn)?我們該如何選擇?

印跡所使用的膜的類型可能影響下列因素:

•蛋白質(zhì)結(jié)合能力

•是否需要用醇預(yù)濕

•開展多次剝離(stripping)和再生檢測(reprobing)實(shí)驗(yàn)的能力

•蛋白質(zhì)觀察

•長期印跡保存

•信噪比

聚偏二氟乙烯(PVDF)和硝酸纖維素是Western印跡應(yīng)用中最常用的兩種類型的膜。

與硝酸纖維素膜相比,電轉(zhuǎn)到PVDF膜上有許多優(yōu)點(diǎn)。PVDF膜可提供更好的蛋白質(zhì)截留率、物理強(qiáng)度和廣泛的化學(xué)兼容性(Pluskal等,1986)。其中更高的機(jī)械強(qiáng)度和出色的耐化學(xué)性讓PVDF膜成為免疫檢測中各種染色應(yīng)用和二次檢測的理想選擇。使用PVDF膜的另一個優(yōu)點(diǎn)是,單塊凝膠上的平行重復(fù)泳道可用于各種應(yīng)用中,如考馬斯藍(lán)染色,接著切割條帶進(jìn)行N端測序,蛋白質(zhì)水解/肽段分離/內(nèi)部測序,以及免疫檢測(Kurien等,2003)。市售的硝酸纖維素膜的典型結(jié)合能力是80 – 100 μg/cm2,而PVDF膜的結(jié)合能力是100 – 200 μg/cm2。

在檢測血清中人免疫缺陷病毒(HIV)時直接比較PVDF和硝酸纖維素膜,結(jié)果表明,PVDF膜有著更好的總體HIV抗原截留率,并且有助于改善提高抗體對糖基化包膜抗原的檢測(Lauritzen和 Pluskal,1998)。硝酸纖維素膜和PVDF膜的特性比較詳見表1。

表1. PVDF和硝酸纖維素膜特性及應(yīng)用的比較

特性/應(yīng)用硝酸纖維素PVDF
物理強(qiáng)度
蛋白質(zhì)結(jié)合能力80 – 100 μg/cm2100 – 300 μg/cm2
耐溶劑性
Western轉(zhuǎn)移
總蛋白染料膠體金膠體金
麗春紅麗春紅
氨基黑氨基黑
印度墨汁印度墨汁
Sypro®印跡染料考馬斯藍(lán)染料
檢測顯色顯色
化學(xué)發(fā)光化學(xué)發(fā)光
熒光熒光
放射性化學(xué)熒光

放射性
雙印跡方法
快速免疫檢測
Western再次雜交
Edman測序
氨基酸分析
SDS存在下的結(jié)合
膜上消化或質(zhì)譜分析
直接MALDI-TOF MS分析
數(shù)據(jù)可存檔

默克密理博提供四種PVDF膜:

• Immobilon®-P膜(0.45 μm)是一種通用的基質(zhì),適用于一般的免疫印跡應(yīng)用。

• Immobilon®-PSQ膜(0.2 μm)適用于蛋白質(zhì)測序和低分子量蛋白的免疫印跡。它有著更高的蛋白質(zhì)結(jié)合能力以及比0.45 μm膜更高的截留率。

• Immobilon®-FL膜(0.45 μm)是為熒光免疫檢測而開發(fā)的。它在多種激發(fā)和發(fā)射波長范圍內(nèi)的熒光背景都極低。

• Immobilon®-E膜(0.45 μm)是第一個用于蛋白質(zhì)印跡的PVDF膜,可以用水性轉(zhuǎn)移緩沖液潤濕。這省去了其他PVDF膜所需的酒精預(yù)濕步驟。

Immobilon®轉(zhuǎn)印膜以卷膜和方片膜形式提供。預(yù)切好的膜與所有預(yù)制膠以及大部分市售的凝膠電泳系統(tǒng)兼容。Immobilon®轉(zhuǎn)印膜的性質(zhì)詳見表2。表3列出了與最常用的電泳系統(tǒng)相匹配的Immobilon®預(yù)切膜的尺寸。表4列出了與現(xiàn)有的預(yù)制膠相匹配的Immobilon®預(yù)切膜的尺寸。

表2. Immobilon® PVDF轉(zhuǎn)印膜的性質(zhì)和應(yīng)用


Immobilon®-P轉(zhuǎn)印膜Immobilon®-PSQ轉(zhuǎn)印膜Immobilon®-FL轉(zhuǎn)印膜Immobilon®-E PVDF膜
描述為結(jié)合從各種凝膠基質(zhì)上轉(zhuǎn)移的蛋白質(zhì)而優(yōu)化均一的孔徑結(jié)構(gòu)帶來分子量<20 kDa的蛋白質(zhì)的出色結(jié)合為熒光免疫檢測應(yīng)用而優(yōu)化首個用于蛋白質(zhì)印跡的PVDF膜,可以用水性轉(zhuǎn)移緩沖液潤濕
組成PVDFPVDFPVDFPVDF
孔徑大小0.45 μm0.2 μm0.45 μm0.45 μm
疏水性疏水疏水疏水疏水
應(yīng)用Western印跡低分子量Western印跡Western印跡
結(jié)合分析Western印跡斑點(diǎn)/狹縫印跡
氨基酸分析氨基酸分析熒光免疫檢測
N端蛋白測序質(zhì)譜分析

斑點(diǎn)/狹縫印跡N端蛋白測序

糖蛋白觀察


脂多糖分析


質(zhì)譜分析


檢測方法顯色顯色熒光化學(xué)發(fā)光
化學(xué)熒光熒光顯色顯色
化學(xué)發(fā)光化學(xué)熒光化學(xué)熒光放射性
放射性化學(xué)發(fā)光化學(xué)發(fā)光

放射性

蛋白質(zhì)結(jié)合能力胰島素:160 μg/cm2胰島素:262 μg/cm2胰島素:155 μg/cm2胰島素:160 μg/cm2
BSA:215 μg/cm2BSA:340 μg/cm2BSA:205 μg/cm2BSA:215 μg/cm2
山羊IgG:294 μg/cm2山羊IgG:448 μg/cm2山羊IgG:300 μg/cm2山羊IgG:294 μg/cm2
兼容的可逆染料透射法透射法透射法透射法
麗春紅麗春紅麗春紅麗春紅
CPTSCPTSCPTSSypro® ruby
甲苯胺藍(lán)甲苯胺藍(lán)Sypro印跡染料
Sypro®印跡染料Sypro印跡染料

兼容的不可逆染料考馬斯亮藍(lán)染料考馬斯亮藍(lán)染料考馬斯亮藍(lán)染料考馬斯亮藍(lán)
氨基黑氨基黑氨基黑氨基黑
印度墨汁印度墨汁
印度墨汁
膠體金膠體金
膠體金

表3. Immobilon® PVDF預(yù)切轉(zhuǎn)印膜和匹配的電泳系統(tǒng)

ManufacturerVertical Gel BoxGel size(cm)Immobilon® Size (cm)Immobilon® NOW format compatibleImmobilon®-P 0.45 μmImmobilon®-PSQ 0.2 μmImmobilon®-FL 0.45 μm*Immobilon®-E 0.45 μm
GE HealthcareSE 250 Mighty Small™8 × 78.4 × 7IPVH07850ISEQ07850IPFL07810IEVH07850
SE 260 Mighty Small™8 × 9.58 × 10
IPVH08100ISEQ08100
IEVH08100
miniVE8 × 9.58 × 10
IPVH08100ISEQ08100
IEVH08100
8.5 × 1010 × 10
IPVH10100ISEQ10100IPFL10100
SE 40014 × 1615 × 15
IPVH15150ISEQ15150

SE 60014 × 1615 × 15
IPVH15150ISEQ15150

14 × 813.5 × 8.5IPVH08130ISEQ08130

Bio-RadMini-PROTEAN® 3 Dodeca™8.3 × 7.38.4 × 7IPVH07850ISEQ07850IPFL07810IEVH07850
Criterion™, Criterion™ Dodeca™13.3 × 8.713.5 × 8.5IPVH08130ISEQ08130

PROTEAN® II xi16 × 1615 × 15
IPVH15150ISEQ15150

16 × 2026.5 × 375
IPVH00010ISEQ00010IPFL00010
PROTEAN® II XL19.3 × 18.320 × 20
IPVH20200ISEQ20200IPFL20200
PROTEAN®   Plus Dodeca™20 × 20.526 × 26
ISEQ304F0ISEQ304F0

Mini-PROTEAN® Tetra8.3 × 7.38.4 × 7IPVH07850ISEQ07850IPFL07810IEVH07850
InvitrogenXCell SureLock™ Mini-Cell8 × 88.4 × 7IPVH07850ISEQ07850IPFL07810IEVH07850
XCell4 SureLock™ Midi8 × 138.5 × 13.5IPVH08130ISEQ08130

Thermo ScientificOwl® P81, P82, P8DS10 × 1010 × 10
IPVH10100ISEQ10100IPFL10100
Owl® P82, P8DS8 × 108 × 10
IPVH08100ISEQ08100
IEVH08100
Owl® P9DS16 × 1615 × 15
IPVH15150ISEQ15150

Owl® P10PS20 × 20.520 × 20
IPVH20200ISEQ20200IPFL20200

表4. Immobilon® PVDF預(yù)切轉(zhuǎn)印膜和匹配的預(yù)制膠

ManufacturerVertical Gel BoxGel size(cm)Immobilon® Size (cm)Immobilon® NOW format compatibleImmobilon®-P 0.45 μmImmobilon®-PSQ 0.2 μmImmobilon®-FL 0.45 μm*Immobilon®-E 0.45 μm
Bio-RadMini-PROTEAN™ TGX, Mini-PROTEAN™ TGX Stain-Free8.6 × 6.88.4 × 7IPVH07850ISEQ07850IPFL07810
Criterion™   TGX, Criterion™ TGX Stain-Free, Criterion™ Tris-HCl, Criterion™ Stain-Free Tris-HCl, Criterion™ XT Bis-Tris13.3 × 8.713.5 × 8.5IPVH08130ISEQ08130

LonzaPAGEr® Gold9 × 108 × 10IPVH08100ISEQ08100
IEVH08100
10 × 1010 × 10
IPVH10100ISEQ10100IPFL10100
NuSepnUView Tris-Glycine, Stain Free8.6 × 6.88.4 × 7
IPVH08100ISEQ08100IPFL07810IEVH07850
8 × 88 × 10
IPVH08100ISEQ08100
IEVH08100
InvitrogenNuPAGE® , Bolt®8 × 88.4 × 7IPVH07850ISEQ07850IPFL07810IEVH07850
Novex®8 × 88.4 × 7IPVH07850ISEQ07850IPFL07810IEVH07850
E-PAGE13.5 × 10.813.5 × 8.5IPVH08130ISEQ08130

ExpedeonRunBlue™ TEO-Tricine SDS8 × 108 × 10
IPVH08100ISEQ08100
IEVH08100
RunBlue™ Tris-Bis10 × 1010 × 10
IPVH10100ISEQ10100IPFL10100
GenscriptExpressPlus™8 × 108 × 10
IPVH08100ISEQ08100IPFL10100IEVH08100
SurePAGE™8.6 × 6.88.4 × 7IPVH07850ISEQ07850IPFL07810IEVH07850
Millipore SigmamPAGE™8.6 × 6.88.4 × 7IPVH07850ISEQ07850IPFL07810IEVH07850
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